西州回鹘是于公元866年到13世纪初的中国新疆地方政权,又称高昌回鹘、和州回鹘。
咸通七年(866年),北庭回鹘大首领仆固俊与吐蕃、黠戛斯大战,收复了西州(今吐鲁番盆地)、轮台(今乌鲁木齐市)、清镇(今玛纳斯县),从此建立了西州回鹘政权。五代至宋,甘州回鹘与中原各王朝关系密切,经常派遣使者朝贡,并接受中原王朝的回赐,同时也通过朝贡的名义和方式,在丝绸之路沿线进行贸易活动。太平兴国六年(981年),西州回鹘王开始自称“西州外生师子阿厮兰汗”,派都督麦索温入宋朝贡,宋太宗以供奉官王延德为正使,殿前承旨白勋为副使,出使西州回鹘。西州回鹘以高昌城为东都,北庭城为下都。天山以北多从事游牧,天山以南则从事农业。多数信仰佛教,高昌城中有众多佛寺。境内有汉人、突厥、大仲云、小仲云、样磨(即咽面)、葛逻禄、格多(吐蕃的一支)等民族。与宋朝和辽朝都有密切的交往。1130年,耶律大石西行,曾经借道于其国,受其回鹘王毕勒哥的盛情款待。西辽建立后,又归附于西辽。
1209年,其王巴而术阿而忒的斤投归成吉思汗,元朝改译为畏兀儿国。海都和都哇之乱时,西州回鹘王纽林的斤率部迁居甘肃永昌。元末明初,成为察合台汗国领土的一部分。西州回鹘国不复存在。