文久二年（1862年）佐幕派的会津藩藩主松平容保就任京都守护职，受命领导“新撰组”打压尊皇攘夷派。在鸟羽伏见之战中，幕府军被明治军击败，松平容保追随末代将军德川庆喜退守江户城。庆应四年（1868年）江户“无血开城”，德川庆喜答应“大政奉还”并退居水户。以萨摩藩、长州藩为首的明治政府军一时间没了战争口实。随即将被视为佐幕派中心的会津藩作为首要军事目标，并命令东北地区的仙台藩、米泽藩等藩国讨伐会津藩。东北诸藩看到会津藩只是因为政局的突然转变而沦为众矢之的，出于对会津藩的同情，一方面上书恳请赦免会津，一方面暗中联合以防不测。
上书到了明治政府下的东征大总督府，被下参谋林通显以“会津藩必须以死谢罪为既定政策”为由拒绝。而后向明治朝廷的上书也被驳回。东北十四个藩国旋即以仙台藩为首，成立了奥羽越列藩同盟以对抗明治政府军。不久仙台藩藩士暗杀明治政府镇抚使-世良修藏成为导火索，战争爆发。
经过白河口和二本松之战，战火燃烧到了会津藩本城-若松城下。明治政府军闪电般的进攻速度，使会津藩来不及集结先前派往各地的守备军。会津藩此刻城内空虚，作为预备部队的“白虎队”成为了守城的重要力量。
白虎队主要由15岁左右的少年所组成，其中甚至有13岁的“幼少组”，编制340人上下。随着战斗的进行，会津藩最终还是没有顶住明治政府军的进攻。破城前后，因听闻明治政府军之前的各种恶劣行径，许多老人、妇女和儿童为不受其辱，选择自尽。而白虎队全体最后战至仅存7人（一说20人），前往附近的饭盛山自杀，仅1人未自杀成功。明治政府军入城后烧杀抢掠，蹂躏妇女，最终导致2500名无辜农民惨死。并且不允许会津藩民替战死的军士收尸，藩民只得趁夜偷偷埋葬部分遗体。在尸体暴露了两个多月后，明治政府为了防止瘟疫爆发才下令处理战场（2017年，日本方面据说找到了一份埋葬名单，试图证明此为讹传）。
会津战争是日本倒幕战争中及其惨烈的一场战斗。明治政府对待会津藩的野蛮行径，导致福岛县若松市（旧会津藩）民众至今仍然反感日本政府和山口县（旧长州藩）、鹿儿岛县（旧萨摩藩）的人民。
1986年，即将纪念戊辰战争120周年的时候，山口县萩市向福岛县若松市表示和解并缔结友好城市，被若松市严词拒绝。
2007年时任山口县众议员的日本前首相安倍晋三访问若松市时对若松市表示道歉。
2011年福岛遭海啸侵袭，核电站事故发生后，山口县萩市第一时间向若松市捐款和物资。若松市市长发表感谢后表示“这不是和解”。
2018年，戊辰战争150周年之际，福岛县若松市，仍张贴出了“会津人不会忘记”的海报。
诸如此类事情很多，也经常影响两地之间的男婚女嫁。这种根深蒂固的隔阂日本人尽皆知，也曾多次被拍进影视剧情节中。
明治四十五年（1912年），在若松市纪念白虎队仪式时，若松市人-富田治制作了“忠勇义烈”会津虎钱表示缅怀。真品制作精致，数量少，参考了江户时期水户虎钱的设计思路，以“忠勇义烈”四字总结赞扬了白虎队少年们的英勇精神。
